A missão "By the Book" exige que os jogadores usem dispositivos de tortura durante o interrogatório de reféns, o que incomodou os críticos
Eles notaram o comentário político do programa sobre o uso da tortura pelo governo dos EUA, mas consideraram o segmento de mau gosto
GameSpot acredita que colocar a cena da tortura ao lado do monólogo semelhante de Trevor cria um elemento falso na função da missão como ferramenta de comentário
A Eurogamer sentiu que os close-ups e os eventos em tempo rápido aumentaram o impacto da sequência além da violência retratada nos jogos Grand Theft Auto anteriores, e sentiu que faltava contexto suficiente à sequência para justificar sua violência.
A missão foi criticada por políticos e instituições de caridade anti-tortura. ] Jornalista independente Tom Chick defende cenas de tortura
e escreve que não é a mesma missão "No Russians" de Call of Duty: Modern Warfare 2 ou o filme Zero Dark Thirty de 2012
O comentário político subjacente sobre a tortura em "By the Book" requer conteúdo violento. A jogabilidade de tortura foi excluída da versão japonesa
Alguns críticos consideraram a representação de mulheres no jogo como misógina; VG247 escreveu que as personagens femininas "são salvas, gritadas, fodidas, vistas fazendo sexo, suportadas, mortas ou gostam de conversar no telefone como uma idiota ou ir às compras".
Edge observou que o jogo trata todos os protagonistas masculinos de maneira semelhante, através de sua propensão estereotipada para a violência.
Depois que Carolyn Petit, da GameSpot, alegou que o jogo era misógino, ela enfrentou reação negativa por sua análise, com usuários postando 20.000 comentários negativos na página e uma petição no Change.org para demiti-la.
Muitos jornalistas defenderam o seu direito de expressar a sua opinião e lamentaram a atitude defensiva da comunidade de jogos contra as críticas.
As lojas de departamentos australianas Target e Kmart retiraram o jogo de suas prateleiras em dezembro de 2014, depois que uma petição da Change.org contra a violência contra as mulheres no jogo reuniu mais de 40.000 assinaturas.
O COO da Take-Two Interactive, Strauss Zelnick, expressou publicamente o desapontamento da empresa com o fato de os jogos estarem sendo retirados dos varejistas, confirmando que ele “apoia nossos produtos, as pessoas que os criam e os consumidores que os jogam”.
A IGN chamou a petição da Change.org de "desinformação", dizendo que suas reclamações sobre as motivações da violência sexual no jogo eram falsas. O Conselho de Classificação Australiano proíbe a violência sexual em jogos, o que significa que a classificação do jogo será recusada
Kotaku diz que a representação de mulheres é inerentemente problemática e que a Target tem o direito de recusar o envio do jogo e a obrigação de responder ao apoio generalizado da petição
Petit (escrevendo para Kotaku) e o estudioso Ben Colliver criticaram o jogo por retratar personagens transgêneros principalmente como profissionais do sexo musculosos.
e descreveu-o como um estereótipo transfóbico prejudicial; Colliver escreveu que esta representação "não reflete as estruturas complexas e diferenciadas que muitas vezes regulam a vida das pessoas trans".
O relançamento de abril de 2022 para PlayStation 5 e Xbox Series X/S removeu o conteúdo de todas as partes do jogo, exceto o Modo Diretor, o que significa que seus modelos são acessíveis, mas não há opções de diálogo
Alguns jornalistas reconheceram que a remoção pode ter sido motivada por uma carta aberta escrita pelo grupo de defesa LGBTQ+ Out Making Games, que solicitou a remoção após ler o artigo de Pettit. A organização elogiou a decisão da Rockstar de remover o conteúdo
Em outubro de 2013, o rapper Daz Dillinger enviou uma carta de cessação e desistência à Rockstar Games e à Take Two Interactive, acusando-os de uso não autorizado de duas de suas músicas.
Em fevereiro de 2014, Karen Gravano, personalidade de TV do reality show Mob Wives, entrou com uma ação judicial contra a Rockstar Games, alegando que os personagens do jogo foram baseados em sua imagem e história e foram retratados sem seu consentimento.
A Rockstar decidiu rejeitar o processo de Gravano em abril, dizendo que as acusações foram rejeitadas pela Primeira Emenda
Em julho, a atriz Lindsay Lohan entrou com uma ação judicial alegando que elementos do jogo, incluindo a personagem Lacey Jonas, tiveram sua imagem, voz e imagem modificadas sem sua permissão e o impacto das linhas de roupas.
A Rockstar respondeu em documentos judiciais buscando encerrar o caso, dizendo que o caso era frívolo e havia sido aberto para fins publicitários. Em 2016, ambas as ações foram julgadas improcedentes